Die Mikrobiologie beschäftigt sich mit der Diagnostik und Therapie von Infektionskrankheiten, die durch Bakterien, Pilze, Viren und Parasiten hervorgerufen werden. Je nach Fragestellung und Verdachtsdiagnose werden Blutkulturen, Urin, Stuhl, Liquor, Hautgeschabsel, Haare, Rachenabstrich, Wundabstrich, Sputum o.a. zur mikrobiologischen Untersuchung verwendet. Die Methoden reichen von Nukleinsäure Amplifikationstests, ELISAs und Schnelltests bis hin zu indirekter sowie direkter Immunfluoreszenz.