Dank praktisch gleicher chemischer Eigenschaften dienen isotopenmarkierte Stoffe als ideale interne Standards zum Eruieren der Spezifikationen von Zielanalyten. Entweder durch das Anreichern mittels 13C oder durch Deuterierung werden Zielmoleküle mit einer bestimmten, festgelegten Anzahl an Isotopen versehen, wodurch eine Änderung von physikalischen bei gleichbleibenden chemischen Eigenschaften bewirkt wird. Insbesondere für massenspektrometrische Untersuchungen zählt die Verwendung eines internen Standards zu den wesentlichen Verbesserungs- & Qualitätssicherungsmaßnahmen der Analyse.