Ein geeignetes Eindeckmedium hilft, die Proben zu konservieren. Die Eindeckmedien für den Chromogennachweis können wässrig oder nicht wässrig sein. Die Eindeckmedien für die Immunfluoreszenz (IF) basieren auf wässriger Basis mit härtender oder nicht härtender Formel. Ein gutes Eindeckmedium für die ZF-Detektion bietet einen idealen Brechungsindex und sollte dazu beitragen, ein Ausbleichen und Verblassen des spezifischen Fluoreszenzsignals zu verhindern.